История группы «ПентАгро» берет свое начало в 1999 г. Впоследствии группа развилась в вертикально интегрированный и сегментально диверсифицированный холдинг, контролирующий все процессы производства и продаж своих продуктов. «ПентАгро» является конечным владельцем производственных активов группы и выполняет функции управляющей компании.

На раннем этапе развития «ПентАгро» формировала свой бизнес в области производства продуктов питания на Дальнем Востоке.

Первым предприятием группы в 1999 году стал «Мясокомбинат Находкинский», одно из старейших предприятий Приморья, основанное в 1950 году. После вхождения в группу, предприятие подверглось качественной модернизации, что превратило его в одно из ведущих мясоперерабатывающих предприятий на Дальнем Востоке. Сейчас производственная мощность завода составляет 9 тыс. тонн продукции в год. Линейка продуктов выпускается под брендом «Доброе Дело».

В 2000-м году активы группы пополнились «Молочным заводом «Уссурийский» (Приморский край), обладающим многолетней историей и традициями выпуска первоклассных и натуральных молочных продуктов. Продукция завода, основанного в 1955г., занимает значительную долю дальневосточного рынка и широко известна среди потребителей своим зонтичным брендом «Родимая Сторонка», а также брендом «Вита Магия». Производственная мощность молочного завода составляет 33 тыс. тонн продукции в год.

2003-й год ознаменовался тем, что экспансия группы расширяется с Дальнего Востока на Центральную часть России. В её состав входит «Птицефабрика Михайловская», которая стала основой для формирования птицеводческого направления группы. Расположенная в Саратовской области, птицефабрика является лидирующим предприятием региона, мощность которого составляет 15 тыс. тонн продукции в год. Продукция предприятия известно в области под брендом «Михайловская курочка».

В 2005-2006 гг. птицеводческий комплекс группы «ПентАгро» пополнился еще двумя предприятиями в Саратовской области - Племенным птицеводческим заводом «Царевщинский-2» и Племенным репродуктором 1 порядка «Зоринским». Оба предприятия, специализирующиеся на промышленном производстве племенных яиц, стали мощной базой и поставщиками для головной фабрики «Михайловская».

Также в 2006 году, активы «ПентАгро» пополняются заводом по производству молочных продуктов «ДАКГОМЗ» расположенном в Хабаровском крае. Производственная мощность данного предприятия составляет 36 тыс. тонн. Таким образом, с вхождением предприятия в группу, её позиции на Дальневосточном рынке молочных продуктов еще более усилились. Продукты завода «ДАКГОМЗ» продаются на рынке под брендами «Родимая Сторонка», «Доктор Сойер», «Вита Магия».

2007-й год стал началом формирования сельскохозяйственного направления группы «ПентАгро». Была создана компания «Русский Гектар», а затем и «Русский Гектар Урожай», которые в течение последующих лет формируют собственный черноземный земельный фонд в Саратовской области. В настоящее время размер данного фонда составляет около 125 тыс. га, 45 тыс. га из которых обрабатываются.